Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms