Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc8D3YZV8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms