Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm6685D3YYP3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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