Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms