Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms