Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms