Protein–RNA interactions for Protein: B1AX35

1700011M02Rik, RIKEN cDNA 1700011M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700011M02RikB1AX35 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700011M02RikB1AX35 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms