Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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1700042G07RikB1AUF7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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1700042G07RikB1AUF7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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1700042G07RikB1AUF7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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1700042G07RikB1AUF7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
1700042G07RikB1AUF7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
1700042G07RikB1AUF7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
1700042G07RikB1AUF7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
1700042G07RikB1AUF7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
1700042G07RikB1AUF7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
1700042G07RikB1AUF7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
1700042G07RikB1AUF7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
1700042G07RikB1AUF7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
1700042G07RikB1AUF7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
1700042G07RikB1AUF7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
1700042G07RikB1AUF7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
1700042G07RikB1AUF7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
1700042G07RikB1AUF7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
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