Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf2A3KGV1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms