Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms