Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm12A2AJ77 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm12A2AJ77 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms