Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms