Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms