Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms