Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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