Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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SEC23BQ15437 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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SEC23BQ15437 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SEC23BQ15437 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SEC23BQ15437 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SEC23BQ15437 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SEC23BQ15437 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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SEC23BQ15437 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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