Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NFIXQ14938 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms