Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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