Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AP000997.1-201ENST00000424313 479 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 OR7H1P-201ENST00000448965 922 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 PPP1R8P1-201ENST00000452549 1044 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 CREM-234ENST00000484283 660 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 SLC22A10-203ENST00000526800 699 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 FTH1-207ENST00000532601 742 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC233290.2-201ENST00000552852 390 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC122685.1-202ENST00000556750 555 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 RN7SL376P-201ENST00000578594 264 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 TANC2-201ENST00000389520 6404 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 STK32B-207ENST00000512636 3272 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 ATMIN-206ENST00000566488 5343 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 MTERF4-222ENST00000614476 4524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 TARS-201ENST00000265112 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 WDHD1-202ENST00000420358 3722 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 EIF4ENIF1-201ENST00000330125 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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MKRN4PQ13434 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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MKRN4PQ13434 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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MKRN4PQ13434 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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MKRN4PQ13434 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 LINC00967-204ENST00000518412 271 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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MKRN4PQ13434 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC244196.5-201ENST00000617347 406 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC005790.1-201ENST00000619774 450 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 CU633906.2-201ENST00000624576 2257 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 TAF1A-201ENST00000350027 1966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 DNAH9-215ENST00000608377 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 USP32P1-202ENST00000393005 3846 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 MRPS31P5-201ENST00000416599 3494 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC009148.1-201ENST00000570148 2693 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 OR9M1P-202ENST00000641564 3163 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
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