Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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VAMP3Q15836 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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VAMP3Q15836 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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VAMP3Q15836 MIR3187-201ENST00000583431 70 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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VAMP3Q15836 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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