Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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