Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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