Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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SIX1Q15475 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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SIX1Q15475 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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SIX1Q15475 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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SIX1Q15475 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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SIX1Q15475 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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SIX1Q15475 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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SIX1Q15475 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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SIX1Q15475 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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