Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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