Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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TCIRG1Q13488 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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