Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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FOXD4Q12950 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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FOXD4Q12950 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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FOXD4Q12950 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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FOXD4Q12950 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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FOXD4Q12950 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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