Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms