Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms