Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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