Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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RTL8BQ17RB0 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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