Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP18Q9UMW8 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP18Q9UMW8 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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