Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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