Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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