Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms