Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrit3W8DXL4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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