Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP4

Serpinb6c, Serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb6cW4VSP4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Serpinb6cW4VSP4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Serpinb6cW4VSP4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms