Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms