Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Upk1bQ9Z2C6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Upk1bQ9Z2C6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Upk1bQ9Z2C6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Upk1bQ9Z2C6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Upk1bQ9Z2C6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Upk1bQ9Z2C6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Upk1bQ9Z2C6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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