Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms