Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xpr1Q9Z0U0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xpr1Q9Z0U0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms