Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AireQ9Z0E3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AireQ9Z0E3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AireQ9Z0E3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AireQ9Z0E3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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