Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms