Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms