Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Usp18Q9WTV6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Usp18Q9WTV6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Usp18Q9WTV6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Usp18Q9WTV6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp18Q9WTV6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp18Q9WTV6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms