Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms