Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms