Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms