Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rnf4Q9QZS2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rnf4Q9QZS2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rnf4Q9QZS2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms