Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms