Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYI7

Dnajb8, DnaJ homolog subfamily B member 8, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb8Q9QYI7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajb8Q9QYI7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajb8Q9QYI7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajb8Q9QYI7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajb8Q9QYI7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Dnajb8Q9QYI7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Dnajb8Q9QYI7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Dnajb8Q9QYI7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Dnajb8Q9QYI7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Dnajb8Q9QYI7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Dnajb8Q9QYI7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Dnajb8Q9QYI7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Dnajb8Q9QYI7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Dnajb8Q9QYI7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Dnajb8Q9QYI7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajb8Q9QYI7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms